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實時熒光定量PCR儀的操作原理

更新時間:2025-10-10瀏覽:128次

實時熒光定量PCR儀(Real-timePCR,也叫qPCR,QuantitativePCR)是一種用于定量分析DNA或RNA樣品中目標序列的方法。與傳統的PCR(聚合酶鏈式反應)不同,實時PCR在PCR反應過程中實時監測熒光信號的變化,通過熒光信號的強度來實時定量目標基因的擴增量。其操作原理主要涉及以下幾個方面:  
1.PCR基本原理  
PCR是利用熱穩定DNA聚合酶在不同溫度下反復擴增特定DNA序列的過程,包含以下幾個基本步驟:  
變性(Denaturation):將DNA模板加熱到高溫(一般為94-98°C),使DNA雙鏈分開,得到單鏈DNA。  
退火(Annealing):溫度降低(一般為50-65°C),使引物與單鏈DNA模板互補結合。  
延伸(Extension):溫度提高至聚合酶最適工作溫度(一般為72°C),聚合酶在引物的幫助下將游離的dNTP(脫氧核糖核苷三磷酸)加到DNA模板上,擴增出新的DNA鏈。  
2.實時PCR與傳統PCR的不同  
傳統PCR僅在反應結束后,通過凝膠電泳檢測擴增產物的量。而實時PCR則在擴增的每一個循環中,通過熒光信號的變化來實時監控擴增的過程。實時熒光PCR具有高靈敏度和高特異性,能夠定量分析基因的表達量、突變、拷貝數等。  
3.熒光信號的監測  
實時PCR通過熒光染料或探針的熒光信號來監控DNA擴增的過程。熒光信號與擴增產物的量成正比,隨著PCR反應的進行,熒光信號逐漸增加。  
熒光信號監測的兩種主要方式:  
SYBRGreen染料法:SYBRGreen是一種熒光染料,它能特異性地結合到雙鏈DNA上。當SYBRGreen與雙鏈DNA結合時,會發出熒光。每擴增一個DNA片段,熒光強度就增加。  
探針法(TaqMan探針法):使用特定的熒光標記探針進行擴增檢測,探針通常由一個熒光染料和一個猝滅劑組成,只有在探針被聚合酶的5'→3'外切酶活性水解時,熒光染料才會被激發并釋放出信號,從而實現定量。  
4.實時PCR的操作原理  
實時熒光定量PCR的基本操作原理是監測熒光信號隨著PCR擴增過程中的變化來定量DNA或RNA的濃度。具體原理如下:  
循環數與熒光信號:隨著PCR反應進行,每一輪擴增都會增加目標DNA的數量。熒光信號的強度與擴增產物的量成正比。在早期擴增階段,熒光信號較弱,但隨著擴增產物的增加,熒光信號逐漸增強。  
閾值循環數(Ct值):在PCR反應中,熒光信號會在某一時刻超過設定的閾值(Threshold),此時的循環數即為Ct值(Cyclethreshold)。Ct值越小,表示目標基因的初始量越多;Ct值越大,表示初始量越少。  
5.定量分析過程  
標準曲線法:通過構建已知濃度的標準樣本的標準曲線,可以將未知樣本的Ct值與標準曲線進行比對,從而得到目標基因的初始濃度。  
ΔCt法:通過測量目標基因和內參基因的Ct值差異(ΔCt),進而比較不同樣本中目標基因的相對表達水平。  
ΔΔCt法:通過計算不同實驗組之間的ΔCt差異(ΔΔCt),來分析目標基因在不同條件下的表達變化。  
6.實時PCR儀的構成與工作流程  
實時熒光定量PCR儀一般由以下部分組成:  
熱循環模塊:用于加熱和冷卻樣本,使其在各個溫度階段進行變性、退火、延伸等反應。  
熒光檢測模塊:檢測PCR反應中產生的熒光信號,實時監測擴增過程中的熒光變化。  
數據分析軟件:通過分析熒光數據,自動計算出Ct值,并進行數據處理和結果輸出。  
操作流程:  
樣本準備:將DNA或RNA模板、引物、熒光染料(或探針)、酶和緩沖液等混合,準備PCR反應體系。  
加入反應板:將反應體系加入96孔板或其他適用的反應板中,并在PCR儀中放置好。  
啟動反應:設置合適的溫度循環程序,啟動實時PCR反應。  
數據采集:在每個擴增循環結束時,PCR儀會自動記錄熒光信號,并生成實時熒光數據。  
分析結果:根據熒光數據計算Ct值,并進行相應的定量分析。  
7.總結  
實時熒光定量PCR儀利用熒光信號監測DNA擴增的過程,通過熒光信號的強度反映PCR產物的量,進而實現對目標基因的定量分析。其高靈敏度和高特異性使其成為基因表達分析、病原檢測、基因組研究等領域的重要工具。